微流控芯片的五大優勢各自如下所示：

（1）集成小型化與自動化

微流控技術能將樣品檢測流程集中化在一個小處理芯片上，根據過流道的尺寸大小折射率、微閥和內腔設計方案的搭配，把這些操作流程集成下去，終使全部檢測集成小型化、自動化技術。

（2）高通量測序

因為微流控能夠設計成多路操縱，根據微通道互聯網，能將被測樣品與此同時劃分成好幾個反映模塊，并把反映模塊彼此防護，使每一個反映不互相影響。因而，可以根據需要用同一個樣版并行處理檢測多個項目。與常規逐一檢測對比，大大縮短了檢測時長，提升了檢測高效率，具備高通量測序的特征。

（3）檢測實驗試劑耗費少

因為集成檢測的小型化，使該處理芯片里的反映模塊內腔特別小，盡管實驗試劑成分的濃度值可能會有一定比例的提升，可是實驗試劑需求量遠低于基本實驗試劑，能夠降低試劑的使用量。

（4）樣本數要求少

由于只需在一個小處理芯片上進行檢測，因此需要檢測的樣本數特別小，通常只需在μm乃至納米。除此之外，還也可以用全血檢測。針對嬰兒、老人和傷殘人而言，血流量小，靜脈血管收集艱難，檢測比較方便；或是稀缺樣品十分寶貴，能夠檢測好幾個指標值。

（5）環境污染少

因為微流控芯片的集成作用，實驗室中全部必須人工完成實際操作都全自動集成到處理芯片中，促使人工操作過程中樣品對環境的污染降至比較低。比如，在分子結構核苷酸的檢測中，不論是樣品自身或是制取后用以檢測的核苷酸，都對試驗室造成污染。大氣氣溶膠的蔓延促使后續樣品檢測很容易出現假陽。這也是為什么傳統分子結構核苷酸檢測必須在至少三個房間里進行不一樣的操作。微流控技術的應用很切實解決了這一問題。